La motivation première de l'ufologie est la possibilité de découverte de phénomène(s) nouveau(x) (naturels, surnaturels, extraterrestres ou autre Voir les différentes hypothèses à ce sujet) derrière les observations de phénomènes aériens inexpliqués. Il en existe cependant d'autres :
- Psychologique : étude du témoignage (psychologie de la perception notamment)
- Civique : Expliquer aux gens ce qu'ils ont vu (et qui les a parfois fortement perturbés)
- Militaire
- Maîtriser son espace aérien en y identifiant tout objet volant non identifié / n'y autorisant pas l'accès à des appareils non identifiés.
- Guerre psychologique : comment l'utilisation du concept "ovni" peut permettre de manipuler des témoins (hésitation à témoigner, à contrer une intrusion, engorgement des canaux de communications ennemis signalant des observations)
- Hypothèse d'appareils secrets/prototypes étrangers
- Citoyen : Ne pas laisser la place vide, et donc ne pas abandonner l'étude du sujet aux fantasmes et aux sectes.
- Sociologique
- Historique : Histoire des perceptions merveilleuse dans leur contexte historique, politique ; folklore
- Scientifique : Outre le fait que de refuser l'étude d'un tel phénomène inexpliqué en supposant a priori l'impossibilité de tout progrès scientifique découlant d'une telle étude (alors que des éléments sont réellement troublants), l'ufologie peut être pratiquée comme un exercice scientifique (et de résolution d'énigmes en général) en raison de ses nombreuses difficultés (non reproductibilité stricte, controverses, pluridisciplinarité, tests d'hypothèses). L'ufologie a ainsi d'or-et-déjà apporté la réponse à certaines énigmes (rods, méprises...)
- Epistémologique : Les difficultés de l'ufologie posent des questions sur la notion de science, et ses relations avec celle-ci
- Culture générale : histoire/folklore, scientifique, militaire, politique.