Fahrney naît à Grove (Oklahoma).
En , alors capitaine, Fahrney commence des expériences sur les missiles guidés pour la Marine US à Point Mugu (Californie). Il conçoit avec ses ingénieurs le missile à œil télévisé. Tous les développements ultérieurs de l'Armée et de l'Air Force émergeront par la suite des premiers travaux du capitaine Fahrney.
Face à l'explication d'ovnis comme autant de missiles guidés, Fahrney déclare à Donald E. Keyhoe :
Je peux vous dire simplement que les Soucoupes Volantes ne sont pas des missiles guidés de la Marine, de l'Armée ou de l'Air Force. Aucun officier de missile guidé ne serait assez stupide pour procéder à des essais d'un tel appareil le long de lignes aériennes ou au-dessus de villes. Ce serait une négligence criminelle — une défaillance mécanique pourrait mettre des vies en danger. Même lorsque l'on lance un missile au-dessus de l'océan, on vide la zone d'essais et assure qu'elle soit patrouillée durant les opérations .
Fin -début , l'amiral Fahrney prend un court moment la direction du NICAP derrière Thomas Townsend Brown.
Le , Farney déclare qu'aucun appareil terrestre n'est capable de reproduire les performances des objets volants observés, pénétrant notre atmosphère .
Suite à la maladie de sa femme et la lourdeur des charges de son travail, il cède la direction du groupe à Keyhoe .
En , toujours fidèle à sa spécialité, il publie un article sur la genèse du missile de croisière .